Bioinformática acelera desenvolvimento de pesquisas
Edicão 101

O NBI (Núcleo de Bioinformática Estrutural), da Embrapa Informática Agropecuária, instalado no campus da Universidade de Campinas (SP), tem um dos pacotes de software de bioinformática mais sofisticados do país e do mundo. O SMS (Sting Millenium Suíte) e sua nova versão, Gold Sting, auxiliam no desenvolvimento de pesquisas sobre plantas e animais visando à produção de medicamentos e plantas resistentes a doenças.
O sistema, um conjunto de ferramentas para analisar estruturas de proteínas, é resultado do trabalho de um grupo de cientistas e especialistas em bioinformática liderado pelo pesquisador Goran Neshich, PhD em biofísica.
Neshich e sua equipe selecionaram diversos softwares livres e bancos de dados públicos disponíveis em universidades e centro de pesquisa ao redor do mundo integrando-os em um único conjunto de ferramentas para facilitar a visualização e a análise da estrutura das proteínas. “Somos um dos poucos laboratórios da América Latina que, em vez de apenas importar trabalho dos outros, oferecemos softwares livres para pesquisadores de diversas partes do mundo”, diz o pesquisador. Segundo ele, o SMS, que é constantemente aprimorado, tem como objetivo oferecer um ferramental completo para estudos de macromoléculas. Informações como posição dos aminoácidos na seqüência e na estrutura da proteína, busca de padrões, identificação de vizinhança, ângulos e distâncias entre átomos, entre outras, são facilmente obtidas. As simulações feitas no computador reduzem a quantidade de testes “in vitro” e bioensaios racionalizando o tempo de pesquisa e aumentando a confiabilidade das mesmas.
Antes da criação do Sting já existiam, em universidades e centros de pesquisa, alguns softwares para esse tipo de estudo, mas tudo era muito complicado de usar e demorado porque os pesquisadores tinham que buscar diversos sistemas em diferentes lugares para fazer uma análise.

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