BIEM - Bioinformática a serviço da Embrapa

Curso de Bioinformática Genômica

O curso de Bioinformática Genômica é uma proposta do projeto BIEM e pretende dar ênfase ao aspecto aplicado da bioinformática genômica. O treinamento é destinado preferencialmente a pesquisadores e estudantes de pós-graduação da EMBRAPA associados a projetos que utilizem ferramentas de bioinformática genômica.

Inscrições Encerradas
Número de vagas: 20
Data limite para inscrição: 21 de Novembro
As inscrições encerram-se às 14:00 hs

Os 20 alunos selecionados para participar do curso serão comunicados entre os dias 23 e 25 de Novembro.
A listagem dos alunos selecionados estará disponível neste site no dia 25 de Novembro.

Pesquisadores selecionados

Informações sobre local do curso

Material didático

Sugestão de hospedagem em Juiz de Fora:
Hotel Serrano (www.serranohotel.com.br),
Rua Santa Rita, 399 - Centro
Diárias para participantes do curso
Quarto individual: R$ 70,00
Quarto duplo: R$ 90,00

Lista de participantes com reserva no Hotel Serrano

Objetivos:

  • Compreender os conceitos básicos e alguns conceitos avançados de bioinformática e seus fundamentos e aplicações,
  • prover o treinamento em ferramentas existentes e a compreensão da teoria e algoritmos sobre os quais estas se baseiam,
  • prover uma introdução à análise de genomas,
  • capacitar os participantes a utilisarem as ferramentas mais comuns e realizar uma analise crítica das mesmas,
  • permitir o contato com novas tecnologias e sistemas,
  • familiarizar os participantes com novos sistemas de análise de dados biológicos,
  • apresentar alguns recursos computacionais disponíveis na Internet e sua utilidade,
  • discutir as necessidades dos usuários para a bioinformática da Embrapa.

Data: 12 a 16 de dezembro de 2005
Carga Horária: 40 horas
Coordenação: Comitê Gestor BIEM
EMBRAPA – Gado de Leite – Juiz de Fora

Local onde será realizado o curso:
Universidade Salgado de Oliveira-Universo
Campus de Juiz de Fora
Endereço:
Av. dos Andradas 731, - Morro da Glória
Juiz de Fora - MG

 

Valor:

- Pesquisadores da Embrapa e estudantes de pós-graduação com projetos associados à Embrapa - gratuito
- Demais pesquisadores e estudantes de pós-graduação - R$ 120,00

Programação:

1° Dia
2° Dia
3° Dia
4° Dia
5° Dia
Manhã
  • Introdução a Bioinformática Genômica
  • Conceitos de biologia molecular aplicados a Bioinformática Genômica
  • Preparo das amostras biológicas
  • Definições de cenários

Tarde

  • Prática computacional
  • Introdução ao Linux
  • Uso dos programas PHRED/PHRAP, CROSSMATCH
  • Sistemas de armazenamento de dados e pré-processamento - Sistema
    Genoma

Manhã

  • Bibliotecas de cDNA
  • Sequenciamento de DNA
  • Montagem e agrupamento de seqüências genômicas

Tarde

  • Prática computacional
  • Uso dos programas CAP3, CONSED
  • Conceitos da linguagem de programação PERL

Manhã

  • Evolução e Filogenia
  • Processamentos e bancos de dados

Tarde

  • Prática computacional
  • Uso dos programas BLAST, CLUSTAL, PHYLIP e MEGA2
  • Conceitos da linguagem de programação PERL

Manhã

  • Anotação de Genes, vias metabólicas e assinaturas de proteínas
  • Genômica comparativa
  • Aplicações de “gene hunting”

Tarde

  • Prática computacional
  • Anotação e filogenia, uso dos programas BIOEDIT, BBH, WINE, JALVIEW
  • Conceitos da linguagem de programação PERL
  • Seminários

Pesquisadores e Facilitadores:

  • Marcos Mota – Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia
  • Roberto Togawa – Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia
  • Felipe R. da Silva – Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia
  • Natália F. Martins – Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia
  • Cláudia Guimarães – Embrapa Milho e Sorgo
  • Marcelo M. Brígido – Universidade de Brasília